Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tnp2P11378 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tnp2P11378 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Tnp2P11378 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Tnp2P11378 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp2P11378 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Tnp2P11378 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms