Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FlgP11088 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FlgP11088 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FlgP11088 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FlgP11088 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FlgP11088 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FlgP11088 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FlgP11088 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FlgP11088 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FlgP11088 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FlgP11088 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FlgP11088 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FlgP11088 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FlgP11088 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms