Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp1P08042 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp1P08042 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms