Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06321 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06321 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06321 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06321 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06321 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06321 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms