Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrygdP04342 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrygdP04342 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms