Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-LP01897 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-LP01897 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms