Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01679 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01679 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01679 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01679 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01679 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01679 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01679 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01679 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01679 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01679 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01679 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01679 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01679 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01679 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01679 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01679 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01679 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01679 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms