Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01663 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01663 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01663 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01663 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01663 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01663 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01663 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01663 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01663 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01663 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01663 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms