Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01649 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01649 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01649 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01649 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01649 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01649 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01649 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01649 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01649 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01649 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01649 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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