Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcn2O88968 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms