Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MscO88940 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MscO88940 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MscO88940 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MscO88940 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MscO88940 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MscO88940 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MscO88940 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MscO88940 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MscO88940 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MscO88940 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MscO88940 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms