Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ShdO88834 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ShdO88834 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ShdO88834 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ShdO88834 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ShdO88834 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ShdO88834 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms