Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl22O88430 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl22O88430 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms