Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd46O88174 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd46O88174 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms