Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd70O55237 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd70O55237 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms