Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mmp10O55123 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms