Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms