Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdk5r2O35926 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms