Protein–RNA interactions for Protein: O35719

Rad51b, DNA repair protein RAD51 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51bO35719 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51bO35719 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad51bO35719 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms