Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc27a2O35488 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc27a2O35488 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms