Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sema6aO35464 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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