Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkd2O35245 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkd2O35245 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkd2O35245 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms