Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ArxO35085 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArxO35085 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArxO35085 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArxO35085 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ArxO35085 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ArxO35085 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ArxO35085 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ArxO35085 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ArxO35085 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ArxO35085 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ArxO35085 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ArxO35085 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ArxO35085 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ArxO35085 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ArxO35085 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms