Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl1O09117 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms