Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snap23O09044 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap23O09044 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms