Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20878L7N244 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20878L7N244 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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