Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2056J3QQ02 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms