Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm20696H3BJN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm20696H3BJN7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm20696H3BJN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm20696H3BJN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm20696H3BJN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm20696H3BJN7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm20696H3BJN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20696H3BJN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms