Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf148G3X9R7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms