Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hmgxb3G3X9M3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms