Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nccrp1G3X9C2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nccrp1G3X9C2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms