Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ScaperF8VQ70 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ScaperF8VQ70 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms