Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Colca2F8VPY8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Colca2F8VPY8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms