Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm17555F6U8B9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17555F6U8B9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms