Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms