Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Herc6F2Z461 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Herc6F2Z461 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms