Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aknad1E9Q8N6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aknad1E9Q8N6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aknad1E9Q8N6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms