Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col22a1E9Q7P1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col22a1E9Q7P1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms