Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85cE9Q6B2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms