Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BC005561E9Q5E2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BC005561E9Q5E2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms