Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r56E9Q4U5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn2r56E9Q4U5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn2r56E9Q4U5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn2r56E9Q4U5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms