Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4N7

Arid1b, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid1bE9Q4N7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arid1bE9Q4N7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arid1bE9Q4N7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arid1bE9Q4N7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arid1bE9Q4N7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arid1bE9Q4N7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arid1bE9Q4N7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arid1bE9Q4N7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arid1bE9Q4N7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms