Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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