Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms