Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3095E9Q058 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms