Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fndc1E9Q043 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms