Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scaf11E9PZM7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf11E9PZM7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms