Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd1E9PZ26 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms