Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5415E9PXF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms