Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Srp54bE9PXC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms